不过朱载坖要实施两宋的编管制度，还是要在两宋的制度上加以损益，朱载坖召集司礼监、厂卫商量之后，将大明版的编管制度给弄了出来。
和两宋的编管相比，朱载坖所制定的编管制度有几个不同，首先就是编管地方的不同，两宋的编管，实际是流刑的变种，将犯罪的官员以编管的名义予以流放到边远地区，所以两宋的编管具有很大的随意性，编管的地点主要以流刑的判罚为主。
但是朱载坖显然不会这么做，朱载坖认为编管主要是用于惩罚政治犯的，适用于一些以言行获罪，谤讪君上，心怀怨望，但是犯罪情节较轻，还不至于严惩的犯官，对于他们，就采取这种编管的惩罚方式，一方面加以惩罚，另一方面予以观察。
所以不能放的太远，朱载坖认为，主要就在京师附近和北直隶的皇庄中，同时编管的监管机构也由地方州县转移到厂卫中来，朱载坖不可能让地方官府来承担监管这些编管犯官的职责，这岂不是让老猫看鱼，监管这些编管犯官的只能是厂卫。
同时对于这些被编管的犯官，朱载坖要求厂卫对他们采取更加严厉的监督手段，朱载坖觉得所谓编管，就是编而管之，被编管的犯官，他们的一切言论、文字都要由负责监管他们的校尉予以记录，定期上奏锦衣亲军都指挥使司和东厂，然后送朱载坖处批阅。
而且被编管的犯官既然到了皇庄，就要分给他们一块地，让他们耕种，自食其力，亚圣曾言：“故将降大任于是人也，必先苦其心志，劳其筋骨，饿其体肤，空乏其身，行拂乱其所为，所以动心忍性，曾益其所不能。”
种种地怎么了，士农工商，农民没什么不好的，朱载坖觉得，这些犯官之所以一有那么多的想的，就是吃饱了撑的，给他们找点事情做，当然，朱载坖也不会落下虐待他们的骂名的，虽然是编管，但是还是要保障他们的基本生活的，照京营士卒发给钱粮。
同时，被编管的犯官每月还要给奏疏，向朱载坖汇报自己编管的心得体会，认罪悔罪的态度，这些都是以后是否解除编管的凭证，你们不是喜欢写吗？那就好好写，多写点啊！
而且朱载坖还规定，由于编管犯官大多数是政治犯，所以编管不能量移、叙免，也不能赎刑，甚至是大赦也都不能赦免编管，除非大赦专门提及赦免编管犯官，而这些编管犯官一经赦免，除名勒停，剥夺所有的功名，除非皇帝特旨赦免。
面对朱载坖的这个提议，重臣们都没有第一时间表态，朱载坖还真是贯彻了自己的意志，就是不杀人，只诛心，和太祖、成祖时大开杀戒的办法不同，朱载坖是准备用编管来对付那些政治上的异己，编管毕竟不像其他的刑罚，血淋淋的，但是其痛苦程度觉不亚于这些肉刑甚至是死刑。
编管犯官看似有一定的自由，也享受一定的待遇，但是通信、言论等全部受到厂卫的严密监视，一旦有任何言行越轨的行为，朱载坖立马就可以收拾他们，同时编管相当于政治生命的结束，不仅是本饶甚至是祸及子孙的，在被解除编管之前，三代子孙不得参与任何考试，完全被剥夺任何政治权力。
即便是被解除编管之后，是否恢复政治权力，也要看皇帝的意思。
海瑞思索了一阵之后道：“陛下，编管犯官古已有之，但是厂卫编管，未免过于严苛，还是要派遣御史定期巡视，以防校尉虐待才是。”
对于海瑞的这个建议，朱载坖予以同意，朱载坖早就过，不杀人，只诛心，要是要杀人，诏狱里有的是办法，要是在编管的犯官中大量的死亡的话，对于朱载坖的名声反而不好，所以朱载坖同意了海瑞的看法，要派遣御史，定期巡察。
还有就是编管的时间问题，重臣们认为，就是流放也还是有时间的，编管也还是要规定一个时间才是，否则岂不是成了无期徒刑，但是朱载坖有不同的看法。
按照两宋的规定，编管就是没有时间的，编管六年以上的犯官可以落户管制地或者他州，但是附籍者不得去其他的州，遇赦也不能移放，编管人死亡后其家属可以自行选择。所以朱载坖认为编管设立时间，古所未有，朱载坖也不会设立时间。
但是李春芳等阁部重臣都请求朱载坖给编管规定时间，毕竟编管犯官在政治上已经没有任何的权力了，甚至子孙后代的政治权力都要受到影响，所以还是规定一个时限比较好。
朱载坖于是和重臣们商量之后认为，编管以三、五、九和永不放还四等，而对于这次要编管的犯官，朱载坖认为上疏申救王祖嫡的，编管九年，支持王祖嫡看法的，永不放还，同时朱载坖还祭出了一个大杀器，追毁出身以来文字，这也是两宋旧例。
所谓追毁出身以来文字，就是把此人出身以来的各种作为官员的身份证明如官告、迁调记录、勘磨记录等等全部予以删除，政治死亡，朱载坖还加上燎科录、各级考试的文章等一律予以删除，凡是被处以编管永不返还的，直接适用追毁出身以来文字，编管三、五、九年的，视情况予以追毁出身以来文字。
朱载坖知道这些文官们想要什么，就是想留名嘛，朱载坖就偏偏不让你留名，将其名字彻底抹去，不仅官方文书档案的所有记录要予以删除，朱载坖还规定，民间刻印被追毁出身以来文字犯官的文集、诗词等的，一律以违制论处，同时，被追毁出身以来文字的犯官，死后不准立碑，要消灭就要消灭的干干净净，彻彻底底。
阁部重臣们对于朱载坖的狠辣有了新的认识，朱载坖确实是善于诛心的。
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