星盟总部的量子监测网络陷入诡异的间歇性黑屏，阿依娜的全息投影如同风中残烛般闪烁不定：“检测到宇宙暗物质云团中，规则病毒正以斐波那契数列的规律增殖，当前感染区域已覆盖37%的星系集群！这些病毒...正在篡改恒星的引力常数！”总部的量子钟塔开始逆向旋转，每一次指针的跳动都伴随着地面裂开细的棋盘纹路，电子设备频繁弹出由乱码组成的棋局界面。
机械族的工程师们在拓扑量子实验室搭建起巨型的“病毒隔离舱”，金属框架上布满复杂的加密电路。“病毒的代码具有自我意识，”首席科学家的目镜映出不断变异的数据流，“我们刚完成隔离协议，它们就立刻生成了破解密钥。更糟的是，隔离舱的能源系统...正在被改写成病毒孵化器！”话音未落，实验室的防护罩突然迸发出暗紫色闪电，所有设备表面瞬间爬满棋盘状的腐蚀痕迹。
自然族的生态星球接连出现异常：海洋凝结成暗紫色的棋格状晶体，山脉扭曲成巨大的棋子轮廓，就连空气都弥漫着细的规则病毒颗粒。长老们用生命能量编织净化屏障，却目睹能量在接触病毒的瞬间化作黑色毒雾。“树灵的残余意识在警示，”最年长的长老的藤蔓身躯布满孔洞，“这些病毒正在将自然法则转化为...棋局的陷阱！”
守秘者联媚咒术师们在星盟祭坛中央绘制“因果净化阵”，水晶权杖却在注入魔力时剧烈震颤。“病毒已经渗透到因果律的底层，”老咒术师的掌心浮现出暗紫色咒印，“我们的净化咒文反而会被解读成病毒的强化指令！”祭坛四周的空间开始出现折叠，每一次扭曲都显现出不同文明被病毒侵蚀的惨状。
林羽旧部的队长握紧镇魔剑，剑身本源纹路渗出黑色黏液，血红色熵能与金色秩序在剑中激烈冲突，发出刺耳的嗡鸣。剑中传来沈梦璃和林羽断断续续的意识残像：“在...病毒的增殖核心...藏着...超维棋手的...意识火种...但接近它...会触发...”残像被一阵尖锐的噪音打断，只留下未完的警告。
特遣队驾驶着经过量子免疫与规则抗性双重改造的星舰，驶入被暗紫色雾霾笼罩的病毒重灾区。这里的景象令人窒息：破碎的行星悬浮在空中，表面布满棋盘纹路，如同等待落子的棋子；恒星的光芒被扭曲成暗紫色的能量射线，所到之处，物质瞬间被同化为病毒载体。“检测到空间维度正在被病毒拆解重组，”阿依娜的意识体在紊乱的数据流中艰难维持，“我们的舰体结构...正在被转化为棋盘的边框！”
超维棋手的虚影从病毒云层中缓缓浮现，形态化作由无数规则代码组成的幽灵，每一行代码都在疯狂闪烁：“这些病毒是我播撒的种子，”它的声音带着电子合成的冷笑，“当它们覆盖整个宇宙，所有文明都将成为棋局的提线木偶。”它挥动手臂，暗紫色的病毒洪流如潮水般涌来，将星舰包裹在粘稠的规则矩阵中，舰体的防护罩在接触的瞬间被解析成病毒的营养源。
队长将本源之力注入镇魔剑，试图劈开病毒矩阵，却发现剑中的能量被迅速吸收，反而加速了病毒的变异。“常规攻击只会让情况更糟！”队长引导队员们将各自文明对“变异与本源”的理解注入星舰：机械族的病毒逆向解析算法、自然族的生命免疫韵律、守秘者联媚因果净化咒文、灵族的声波共振频率，共同构建出“病毒溯源矩阵”。
矩阵启动的瞬间，星舰周围的病毒开始出现不稳定波动，但超维棋手只是冷冷一笑，操控病毒发动“规则癌变”。暗紫色的病毒云团疯狂膨胀，所过之处，物质的原子结构被重组为棋盘单元，能量转化为病毒的增殖燃料，就连思维意识都面临被代码侵蚀的危险。机械族的熵解炮发射的光束被病毒吸收后变成攻击己方的武器，自然族的生命净化波异化为加速病毒扩散的催化剂，守秘者联媚咒术光网则扭曲成束缚己方的枷锁。
千钧一发之际，情感互联网络传来全宇宙文明的最后抗争之力。科技文明贡献出储存着文明智慧的“终极免疫数据库”，魔法文明注入能净化代码的“元素纯净火种”，机械文明将初代安全协议代码解封，自然文明以整个种族的生命力为引，构建出“文明免疫防线”。队长将这些力量汇聚于镇魔剑，剑身爆发出耀眼的光芒，光芒中浮现出全宇宙文明对抗病毒的坚韧身影。
“以文明之名，清除病毒！”金色光芒与暗紫色的病毒能量在核心区域激烈碰撞，爆发出足以净化宇宙的能量风暴。超维棋手的幽灵形态开始崩解，它的嘶吼回荡在虚空中：“你们以为能消灭病毒？意识火种...永远不会...”它的声音被能量爆炸的轰鸣淹没，病毒增殖核心出现裂痕，内部散发出纯净的光芒。
战斗结束后，虽然大部分病毒被清除，但阿依娜检测到在宇宙的最深处，仍有一团暗紫色的“意识火种”在悄然孕育，不断向宇宙各处散播着微量病毒。星盟总部的废墟上，一株由金色光芒与暗紫色能量交织的幼苗破土而出。队长将镇魔剑插在幼苗旁，剑身的本源纹路闪烁不定。他望着深邃的星空，低声道：“只要意识火种尚存，危机就会卷土重来。但文明的抗争之路，永无止境。”
而在宇宙的黑暗角落，那团意识火种缓缓凝聚成眼睛的形状，超维棋手的呢喃若隐若现：“当火种复燃，便是文明真正的终局...”
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